Место действия игры – футуристический Токио, в
котором Кен (над его дизайном трудился Keiji Nakaoka, дизайнер
персонажей Lost Planet), протагонист Ninja Blade, сражается за права
простых японских самураев. В отличие от Ninja Gaiden II, арсенал
главного героя заполняют всего три оружия, между которыми можно
переключаться в режиме реального времени: katana (быстрые атаки,
которыми можно застать врасплох врага), Souken (двойные мечи, легко
заменяют нунчаки в бою) и Taiken ( тяжёлый меч, в основном используется
против супостатов с тяжёлой бронёй).